甘肃省微藻工程技术研究中心是2010年依托河西学院设立的省级微藻工程技术研究机构。下设微藻藻种优选培育研究室、微藻生产技术与产品制备研究室、微藻功效分析与产品检测研究室、微藻生物质能开发研究室、微藻生态与生物技术研究室。

中心是集研究与开发、技术推广、生产与销售、人才培养为一体的综合性微藻研发平台，产出微藻应用研究和科技开发成果，解决微藻产业发展的共性和关键技术问题。促进科技成果转化，提高科技成果的工程化、商品化水平，实现产业化，在微藻领域起到示范、辐射作用，带动微藻行业发展。实施产学研合作教育，探索“科技产业+工程中心+教学院系”的应用型本科教育教学模式，培养应用型创新型人才。成功探索了高等学校、科研机构和企业合作的有效形式和运行机制，实现产学研协同创新，目前已成为河西学院应用科学研究与技术创新基地、社会化服务基地和应用型创新型人才培养基地。

以科教融合、产教融合为主线，贯彻落实创新驱动发展战略，积极与地方、行业和企业合作，实施产学研协同创新，着力构建科研创新体系，推进科技创新，服务地方经济社会发展，取得了一定成绩。先后承担了国家级科研项目3项，省部级科研项目15项，地厅级项目16项，获得项目资金2000余万元。获得省专利二等奖1项、省科技进步三等奖3项、省技术发明三等奖1项、省社科成果二三等奖各1项以及各类地厅级奖励10余项。制订备案甘肃省地方标准1项。在螺旋藻养殖、产品生产加工等方面已经有了成熟的养殖技术和加工工艺，自主设计并建成的连拱体日光能螺旋藻藻种扩繁、养殖和采收一体化系统，研究水平居国内领先，获得国家专利38项，其中发明专利20项。